Ганбастер, Данбастер и Фури-Кури.
Гандамы.
Вселенная Muv-Luv по которой пока вышли 2 сериала : Полное затмение и Черные метки.

В подземелье я пойду, там красавицу найду
Маги
Аватар: Легенда о Корее(Легенда об Аанге)
А так, советую посмотреть: Возрождающие

Наруто и Баруто, мир один, хотя одно аниме а другое высер, но в одной вселенной действие

Monogatari еще можно притянуть

Серия Science Adventure. То есть аниме Врата штейна, Записки робототехники Хаос вершина и Оккультная девятка в одной вселенной крутятся.
Шумиха и Дюрарара.
Парадайз кисс и Истории соседей.
Еще в Золотая пора появляется персонаж из аниме Нана, но можно ли это считать одной вселенной хз так как персонаж внешне, по характеру и имени такой же, но вроде как другой.

Вселенная CLAMP (триплексоголик, хроника крыльев, блуд-с, сакура собирательница карт, икс, Токийский вавилон)
Лейдзиверс (экспресс, харлок, аркадия, эмиральда, королева тысячелетия, галактические дороги)
Шумиха / дюрарара
Science Adventure (врата штейна, записки о роботехнике, хаос вершина, окультная девятка)
Ga-Rei: Zero / Токийские вороны

Сао и ускоренный мир, 2 аниме тип развитое эвалюция технологии будущее 1.
Макросс - вообще вселенная про развитие истребителей и музыки как оружие, в разные сезоны разные способы проявления

тигр и кролик/ двойной удар

по сути вселенная Fate это одна вселенная, но сюжеты разные разных частей

Индекс волшебства - там такой же перец, сюжеты разных сезонов разные, но они переплетаются друг с другом (пример: первый созон индекса и научный рейлган 2 сезон)