Если быть правильным, то первый сезон- чисто ознакомление.
а вот во втором в начале гг находится в мире, где он помнит все свои жизни. там он влюбляется в кагари (ключ луны) и помогает ей найти спасение планеты (гг не должен будет убивать кагари на земле). потом она перерождает гг до того, как он впал в кому. Далее он в своей первой миссии не убивает кагари, а помогает ей. в конце-концов он истрачивает свой запас жизненной инергии и из-за своей способности становится деревом. Далее его делают своим фамиллиаром те школьницы. он отправляется вместе с ними на луну к кагари, чтобы встретится с ней. Крч в итоге он раскрывает миру тайну о создании фамилиаров, земля спасена, гг остается с кагари. Хеппи енд)
а если хочешь понять на 100% советую пройти новеллу.
P..S сам прошел новеллу, поэтому все понятно

Аниме - Адаптация Игры. И нам показывают самые интересные ходы в ней по мнению режиссера. После событий на луне(ТВ-1) Главный герой переживает другую линию жизни, где не был убит "Ключом" и не стал куклой. И это не было комой, Котару был воскрешен друидом, и его жизнь застыла на месте.(Это так же было в первом сезоне)