Ранобэ читай, так как на русском есть полный перевод всех томов. Только ""Последнего эмбриона" нет, и он ещё не скоро появится.

манги по основному сюжету лично я не находил, так что сказать про отличая не могу, видел только побочки. Ну тем не менее могу с уверенестью сказать, что лучше читать ранобэ, тем более что первую арку полностью перевели на русский (а это 12 томов).

Если доступен оригинал(в данном случае ранобэ), то лучше всегда читать оригинал. На то он и оригинал.