Про большинство из тех что тут насоветовали я бы сказал так: да они интересные, да сюжет хороший и есть над чем призадуматься ну я вряд ли бы над ними пустил слезу. Так что вот мой список:

Кланнад (мне кажется тут многие плакали)
Могила светлячков (очень трогательная)
Волчьи дети Амэ и Юки (вряд ли до слез проймет, но все равно довольна трогательное)
Сад изящных слов
Пять сантиметров в секунду
Чей-то взгляд (продолжительность 7 минут, а смысла больше чем во многих аниме)
Код Гиасс (трогательная концовка)

Вообще советую смотреть полнометражные аниме очень много трогательных и довольна интересных. Я например почти все полнометражки от студии Гибли пересмотрел, очень интересные и многие трогательные.

Золотая Пора

корона грешника,дневник будущего

Кланнад