Конец конечно грустный, но если задуматься то в аниме было сказано что Ману можно восресить если поместить ее душу в подходящее тело, то есть в мире аниме есть души, а значит когда Сю умрет (неважно отчего и когда) то его душа встретится с Инори можно сказать в раю, то есть он еще увидит Инори.

Он ослеп. Все помним момент, когда Инори и Шу оказались в одном сознании. Именно тогда и произошла передачи жизненной энергии. На момент её передачи тело Инори было поражено вирусом, именно по этому Шу лишился зрения. В конце заключительной серии видно что у Шу трость для слепых. Всё это и многое другое свидетельствует о его незрячести.

Не думаю, Может с ногой чего случилось???

Ну так то да, ослеп.